Le domaine national de Versailles et de Trianon est depuis 1995 un établissement public à caractère administratif, doté d’une autonomie de gestion administrative et financière. Il est placé sous la tutelle du ministère de la culture et de la communication. A sa tête, se trouve Jean-Jacques Aillagon, président de l'établissement public, assisté d'un conseil d'administration, d’un directeur général et d’un administrateur général.
Le budget consolidé de l’établissement public représente environ 100 millions d’euros par an. Les dépenses de fonctionnement sont financées par les ressources propres de l’établissement, notamment celles qu’il tire de sa billetterie. Les dépenses d’investissement sont financées par une subvention annuelle de l’Etat, par la capacité d’autofinancement de l’établissement et par le mécénat. Tous les produits de l’exploitation sont réinvestis dans les travaux et dans les acquisitions, qui ne bénéficient pas d’une subvention de l’Etat.
L’établissement bénéficie de l’apport en mécénat des entreprises et des particuliers grâce notamment aux nouvelles dispositions de la loi du 1er août 2003. La Société des Amis de Versailles, participe à ce travail de recueil de fonds. Le château de Versailles a financé ainsi, en 2008, plus de 10% de son budget total.